In den vier Primarschuleinheiten (Feldmeilen, Dorfmeilen, Allmend und Obermeilen) und an der Sekundarschule bestehen Schulleitungen. Das Geschäftsreglement der Schulpflege Meilen regelt die Aufgaben und Kompetenzen.

Die Schulleiterinnen und Schulleiter bilden zusammen die Schulleitungskonferenz. Der Leiter ist der Rektor, der für die Koordination zuständig ist.